Para participar do Prouni, o candidato deve ter concluído o ensino médio e atender aos critérios como ter treinado em escola pública, ter sido bolsista em escola privada, ser pessoa com deficiência, ou professor de rede pública. É necessário ter participado do Enem 2023 ou 2024, com média mínima de 450 pontos e sem zerar a redação. As bolsas disponíveis estão para ampla concorrência ou políticas afirmativas.
A inscrição requer conta do Governo do Brasil, CPF, e dados pessoais e familiares. O candidato pode escolher até duas opções de curso e instituição, conforme a renda familiar. O resultado da 1ª chamada será divulgado em 4 de fevereiro, e da 2ª, em 28 de fevereiro. A lista de espera será aberta em março.
Os candidatos à licenciatura com média igual ou superior a 650 no Enem podem participar do programa Pé-de-Meia Licenciatura, recebendo R$ 1.050 mensais durante o curso. A iniciativa integra o programa Mais Professores e comemora os 20 anos do Prouni.